Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms