Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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