Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms