Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXO1Q12778 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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