Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TFF3Q07654 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms