Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms