Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms