Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD83Q01151 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD83Q01151 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CD83Q01151 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms