Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F8P98187 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms