Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRX3P78415 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRX3P78415 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX3P78415 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX3P78415 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX3P78415 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRX3P78415 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms