Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms