Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms