Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM193AP78312 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms