Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms