Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms