Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSCP56915 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSCP56915 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GSCP56915 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSCP56915 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms