Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms