Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK2P53671 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK2P53671 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIMK2P53671 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms