Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPAP53621 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPAP53621 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPAP53621 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms