Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBP50607 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBP50607 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBP50607 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBP50607 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBP50607 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBP50607 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBP50607 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms