Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYB561P49447 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYB561P49447 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYB561P49447 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CYB561P49447 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CYB561P49447 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms