Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACADSBP45954 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms