Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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