Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRGP23470 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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