Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms