Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF3P15923 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF3P15923 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms