Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT13P13646 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT13P13646 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT13P13646 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT13P13646 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT13P13646 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT13P13646 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT13P13646 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms