Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms