Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms