Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
F9P00740 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F9P00740 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F9P00740 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F9P00740 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms