Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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MTSS1O43312 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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MTSS1O43312 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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MTSS1O43312 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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