Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP17L13C9JLJ4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP17L13C9JLJ4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms