Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms