Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms