Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCDC88CQ9P219 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms