Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG3Q9NT62 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms