Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms