Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GOPCQ9HD26 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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