Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms