Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LNPKQ9C0E8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LNPKQ9C0E8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms