Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms