Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC46A2Q9BY10 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms