Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms