Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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