Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CNN2Q99439 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.6 ms