Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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