Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZC2HC1AQ96GY0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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