Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SGF29Q96ES7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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