Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP3Q96DZ5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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