Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTP4Q96DX8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms